该县以5.2万亩辣椒基地为依托，已建成君美辣椒、晨曦椒业、丁丁食品三家辣椒加工企业，以3.5万亩甜菜基地为依托，已形成日处理2200吨甜菜的制糖企业；以6.2万亩加工番茄基地为依托，已建成日处理4500吨的屯河食品公司和高新技术企业红帆科技公司；以4万亩小茴香基地为依托，建成了年加工能力2500吨的焉耆盛源小茴香有限责任公司。在畜牧业方面，重点扶持和发展了集奶牛饲养、育种、乳产品加工为一体的三宇乳业有限公司，该企业奶牛场现存栏奶牛540头，日加工鲜奶能力达120吨；以3万亩葡萄基地为依托，投建了中法合资乡都酒业有限公司1万吨酒厂，正在建设王朝集团万吨葡萄榨汁厂。目前，全县已建成自治区级农业产业化龙头企业3家。