《杂交棉新品种（系）选育》项目系自治州星火计划项目，新疆富全新科种业每年投入2000余万元科研经费用于新品种的研究，近五年内已选育出了四个棉花新品种（系）并已通过自治区审定。该项目利用“公司自主研发+科技特派员+技术推广部门+农户”的经营模式，选用优异特性的品种，采用以人工去雄授粉为主进行组合配对杂交，将品种杂交优势提高单产水平的技术运用在棉花种植上。选育出优良杂交棉，创新棉花品种资源，填补巴州杂交棉新品种选育的空白。目前，该项目已完成了选用优异特性的品种做亲本组合，人工去雄授粉配对杂交等工作，2009年亩制棉种可达120公斤以上，其杂种一代一般增产20-30%，杂种二、三代仍有10-12%的增产优势，杂交棉不仅具有提高棉花产量，而且杂交一代的早熟性、丰产性和纤维品质，都超过了双亲。